数据集概述
本数据集为比利时小河流与大型溪流鱼类群落eDNA代谢组学监测实验数据,基于2018年6月的受控围笼实验,通过引入15种比利时本土鱼类,探究eDNA片段传输稀释规律及分子检测优化方法,分析eDNA相对丰度与笼内物种生物量的相关性,揭示不同流量下eDNA下游信号稳定性,共包含4份关联文件。
文件详解
- README文件
- 文件名称:README_VanDriesscheEtAl2023.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据集标题、主要研究者及联系方式、合作研究者、数据采集时间、地理定位等基础信息
- 计数表文件
- 文件名称:Van_Driessche_et_al._2023_ObiTools_Count_Table.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录eDNA检测的物种计数数据,支持物种相对丰度分析
- 参考数据库文件
- 文件名称:Van_Driessche_et_al.__2023_Reference_Database_Riaz_March2020_amplified_clean_uniq.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含Riaz March2020版本的扩增后清洁唯一序列参考数据库,用于物种比对鉴定
- 统计用清洁数据文件
- 文件名称:Van_Driessche_et_al._2023_Cleaned_Data_for_Statistics.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:经过预处理的统计分析用数据,支持eDNA丰度与生物量相关性、空间信号衰减规律等统计分析
数据来源
论文“Using environmental DNA metabarcoding to monitor fish communities in small rivers and large brooks: Insights on the spatial scale of information”
适用场景
- 河流生态健康评估:通过eDNA数据反演鱼类群落组成,评估河流生态系统健康状态
- eDNA监测方法优化:研究eDNA片段在河流中的传输稀释规律,优化采样方案设计
- 物种生物量关联分析:分析eDNA相对丰度与实际物种生物量的相关性,验证eDNA定量潜力
- 水生态管理应用:为欧洲水框架指令下的河流类型划分及生态监测提供技术支撑
- 分子检测质量控制:探索eDNA分子检测的预测能力与质量保证体系优化路径