数据集概述
本数据集为地中海高山植物Edraianthus graminifolius（桔梗科）的种群遗传研究数据，用于测试巴尔干半岛不同地理尺度隔离因素对其扩散的屏障效率。包含AFLP标记、质体DNA序列、系统发育树及种群编号对照表等5个文件，支持分析该物种的种内分化模式、遗传结构及地理隔离机制。
文件详解
- Edraianthus_graminifolius_uncoded.fas
- 文件格式：FAS
- 字段映射介绍：未编码的质体DNA序列文件，存储该植物种群的原始基因序列数据
- Edraianthus graminifolius_AFLPs.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：AFLP标记数据文件，包含种群的扩增片段长度多态性分析结果
- Edraianthus_graminifolius_coded.fas
- 文件格式：FAS
- 字段映射介绍：编码后的质体DNA序列文件，便于后续遗传分析的格式化序列数据
- Edraianthus_graminifolius_MCC tree.out
- 文件格式：OUT
- 字段映射介绍：最大类群置信度（MCC）系统发育树输出文件，记录种群间的进化关系
- Translation table for population numbers in alignments and treefile.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：种群编号对照表，包含两列内容，第一列为比对文件和树文件中的种群编号，第二列为论文及GenBank中的对应编号，实现不同文件间种群编号的映射匹配
数据来源
论文“Testing the efficiency of nested barriers to dispersal in the Mediterranean high mountain plant Edraianthus graminifolius (Campanulaceae)”
适用场景
- 植物种群遗传分化研究: 利用AFLP标记和DNA序列数据，分析Edraianthus graminifolius的种内遗传结构与地理隔离的关系
- 生物地理屏障效率评估: 验证巴尔干半岛不同地理尺度隔离因素对该物种扩散的阻碍作用
- 系统发育关系分析: 通过MCC树文件探究种群间的进化历史与分化时间
- 生态位建模辅助研究: 结合遗传数据与生态位模型结果，解析物种分布格局的形成机制
- 种群编号标准化映射: 借助对照表实现不同分析文件中种群编号的统一关联，支持多源数据整合分析
