数据集概述
本数据集为俄勒冈生物多样性基因组项目的成果，包含俄勒冈州129种淡水鱼类共313个样本的完整有丝分裂基因组序列。数据用于构建区域基因组参考数据库，解决eDNA监测中物种识别的瓶颈问题，分析线粒体条形码区域的局限性及基因间区域的应用潜力，为生物多样性监测提供技术蓝图。
文件详解
- README.txt（TXT格式）：项目说明文档，包含附录S1（采样计划）、附录S2（系统发育树）、附录S5（数据库构建蓝图）、Box S1（采样工具）、Box S2（采样协议）、Box S3（野外记录单）等内容。
- appendix_s5.xlsx（XLSX格式）：数据库构建蓝图文件，提供区域参考序列数据库开发的标准化流程。
- appendix_s1.xlsx（XLSX格式）：综合采样计划文件，记录样本采集的设计与实施细节。
- appendix_s3.xls（XLS格式）：完整有丝分裂基因组数据文件，包含313个样本的有丝分裂基因组序列信息。
数据来源
论文“Transitioning from environmental genetics to genomics using mitogenome reference databases”
适用场景
- 生物多样性eDNA监测：利用有丝分裂基因组数据优化eDNA物种识别准确性，提升区域生物多样性监测能力。
- 基因组参考数据库构建：为其他区域开发物种基因组参考数据库提供方法学参考。
- 线粒体基因区域应用研究：分析不同线粒体区域（如D-loop）在物种鉴定中的诊断价值。
- 淡水鱼类分类学研究：通过完整有丝分裂基因组序列解析物种间亲缘关系及分类学界限。
- 环境基因组学技术优化：指导现有eDNA检测技术及未来无PCR环境基因组学方法的改进。
