数据集概述
本数据集包含新几内亚特有淡水龟Elseya novaeguineae的线粒体和核基因变异数据，用于检验该物种近期广泛扩散与更古老存续的生物地理学假说。数据记录了其基因结构中反映的中新世地理隔离事件，涉及不同地理种群的分化时间及驱动因素分析。
文件详解
- 基因系统发育文件（.nex格式）
- 文件名称：reduced_gene_set_CR_ND4_phylogeny.nex、full_gene_set__12S_16S_CO1_CytB_phylogeny.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：包含简化基因集（CR、ND4）和完整基因集（12S、16S、CO1、CytB）的系统发育分析数据，用于构建物种进化树
- BEAST分析输入文件（.nex格式）
- 文件名称：nuclear_emydura_group_beast_input.nex、mtdna_emydura_group_beast_input.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：分别包含核基因和线粒体基因的BEAST分析输入数据，用于种群分化时间估算
- BEAST分析输出文件（.nex格式）
- 文件名称：emydura_group_beast_trees_comb_1-7-5_output.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：包含BEAST分析生成的合并进化树输出数据，记录种群分化的时间节点与置信区间
- XML元数据文件
- 文件名称：emydura.group.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：包含数据集的元数据信息，用于描述基因分析的分组与参数设置
数据来源
论文“Contemporary genetic structure of an endemic freshwater turtle reflects Miocene orogenesis of New Guinea”
适用场景
- 生物地理学研究: 分析新几内亚特有淡水龟种群分化与中新世造山运动的关联
- 进化生物学分析: 利用基因变异数据研究物种的进化历史与种群隔离机制
- 淡水龟保护生物学: 基于基因结构数据制定针对性的物种保护策略
- 地质事件与生物演化关联研究: 验证地质变化（如中央山脉隆起、海湾形成）对生物分布的影响
