Empidonax_difficilis_E_occidentalis复合体基因组与地理采样数据集

数据集概述

本数据集为Empidonax difficilis/E. occidentalis复合体（小霸鹟科）的基因组与地理采样数据，覆盖其主要分布范围，包含遗传序列、样本信息及分析结果，用于研究该类群的系统发育关系、隐存谱系及分类学问题。

文件详解

• 序列文件（.nex格式）：
• uce_loci_50p.nex：UCE基因座序列文件
• rad_loci_50p.nex：RADseq基因座序列文件
• ND2_alignment.nex：ND2基因序列比对文件
• 数据表格（.csv格式）：
• S1.csv：样本信息表，包含样本编号、机构、属种、国家、经纬度等字段
• S2.csv：梯度分析结果表，包含样带、模型、中心、宽度、遗传方差等字段
• 文档文件（.pdf格式）：
• supplemental_figures.pdf：补充图表文件

适用场景

• 系统发育研究：分析Empidonax属物种的亲缘关系及分类地位
• 种群遗传学：探究隐存谱系的遗传分化与地理分布格局
• 生物地理学：研究物种复合体的起源与扩散路径
• 分类学修订：评估现有分类系统是否反映真实进化关系
• 基因组学方法验证：测试密集采样对谱系识别的影响