数据集概述
本数据集包含用于提升肾脏肾小管和足细胞基因转移效率的AAV衣壳筛选实验原始数据。主要为支持论文图1和补充图1的AAV Barcode-Seq原始测序读段计数数据，以及AAV衣壳文库中CAGBC101至CAGBC223条形码的转换信息表，帮助关联条形码与对应AAV衣壳类型。
文件详解
- RawData.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：压缩包内包含支持论文图1和补充图1的AAV Barcode-Seq原始测序读段计数数据，每个文件对应一个条形码（BC）PCR产物的NGS读段计数结果，文件名标识对应PCR产物信息。
- VBC_AAV_capsid_Conversion_Table.csv
- 文件格式：CSV
- 字段说明：包含CAGBC101至CAGBC223共123个条形码（BC）与AAV衣壳文库中对应衣壳的转换映射信息，用于将测序数据中的条形码关联到具体AAV衣壳类型。
数据来源
论文“Enhancing gene transfer to renal tubules and podocytes by context-dependent selection of AAV capsids”
适用场景
- 基因治疗载体优化研究：分析不同AAV衣壳对肾脏肾小管和足细胞的基因转移效率，筛选高效靶向载体。
- 生物信息学分析：通过Barcode-Seq原始数据进行测序质量评估、读段计数标准化等生物信息学处理。
- 肾脏疾病靶向治疗研究：为肾脏相关疾病的基因治疗载体设计提供实验数据支持。
- AAV衣壳文库筛选：基于条形码转换表和测序数据，开展大规模AAV衣壳文库的功能性筛选与鉴定。
