EPFL_BIO463_Based_2024批量RNA测序完整数据

数据集概述

该数据集包含2024年4月9日瑞士洛桑联邦理工学院(EPFL)BIO463必修课练习所需的批量RNA测序相关数据,涵盖测序文件、分析数据、协议文档等多种类型文件,为课程实践提供完整数据支持。

文件详解

  • in_chr21.sam:SAM格式文件,可能为第21号染色体的测序比对原始数据
  • data_09_04_2024.RData:R语言数据格式文件,可能为课程练习用的预处理数据
  • protocol.png:PNG格式图片文件,可能为实验或分析流程的协议示意图
  • ttg.csv:CSV格式文件,包含基因信息字段,如target_id(目标转录本ID)、ens_gene(Ensembl基因ID)、ext_gene(外部基因名)、description(基因描述)等
  • in_chr21.bam:BAM格式文件,可能为第21号染色体的压缩后测序比对数据
  • in_chr21.bam.bai:BAI格式文件,为in_chr21.bam的索引文件

数据来源

EPFL(瑞士洛桑联邦理工学院)

适用场景

  • 生物信息学教学:作为BIO463课程RNA测序数据分析练习的实践数据
  • 转录组学基础分析:用于学习RNA测序数据的比对、基因注释等基础流程
  • 基因组学入门实践:帮助理解测序数据格式(SAM/BAM)及索引文件的使用
  • 基因表达相关课程:辅助理解基因ID映射、转录本注释等基础概念
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 110.69 MiB
最后更新 2025年12月11日
创建于 2025年12月11日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。