数据集概述
该数据集包含2024年4月9日瑞士洛桑联邦理工学院(EPFL)BIO463必修课练习所需的批量RNA测序相关数据,涵盖测序文件、分析数据、协议文档等多种类型文件,为课程实践提供完整数据支持。
文件详解
- in_chr21.sam:SAM格式文件,可能为第21号染色体的测序比对原始数据
- data_09_04_2024.RData:R语言数据格式文件,可能为课程练习用的预处理数据
- protocol.png:PNG格式图片文件,可能为实验或分析流程的协议示意图
- ttg.csv:CSV格式文件,包含基因信息字段,如target_id(目标转录本ID)、ens_gene(Ensembl基因ID)、ext_gene(外部基因名)、description(基因描述)等
- in_chr21.bam:BAM格式文件,可能为第21号染色体的压缩后测序比对数据
- in_chr21.bam.bai:BAI格式文件,为in_chr21.bam的索引文件
数据来源
EPFL(瑞士洛桑联邦理工学院)
适用场景
- 生物信息学教学:作为BIO463课程RNA测序数据分析练习的实践数据
- 转录组学基础分析:用于学习RNA测序数据的比对、基因注释等基础流程
- 基因组学入门实践:帮助理解测序数据格式(SAM/BAM)及索引文件的使用
- 基因表达相关课程:辅助理解基因ID映射、转录本注释等基础概念