数据集概述
本数据集围绕病原真菌表观遗传修饰对自发突变率的影响展开,包含实验数据、统计结果、基因组注释等11个文件。数据支撑研究中关于组蛋白修饰(H3K27me3、H3K9me3)、转座子胞嘧啶甲基化及温度胁迫对突变率作用的结论,为解析真菌基因组变异机制提供结构化数据。
文件详解
- 实验与统计数据文件(.xlsx格式,共6个)
- SupplementaryData1_Summary_of_statisticaltest_SourceData.xlsx:包含统计检验结果的汇总数据
- SupplementaryData2_Sequencing_Assembly_Statistics.xlsx:测序组装相关的统计指标
- SupplementaryData3_in-plantaData.xlsx:植物体内实验相关数据
- SupplementaryData4_Validation_calledSNPS.xlsx:SNP验证数据,包含已识别SNP的验证信息
- SupplementaryData5_allMutations.xlsx:所有突变数据的汇总,记录突变位点及相关信息
- SupplementaryData6_Analysis_simulation_structuralvariations.xlsx:结构变异的分析与模拟数据
- 基因组注释文件(.gff/.gff3格式,共2个)
- SupplementaryData7_IPO323_gene_annotation.gff:IPO323菌株的基因注释数据
- SupplementaryData8_IPO323_TEs_annotation.gff3:IPO323菌株的转座子(TE)注释数据
- 组蛋白修饰数据文件(.bed格式,共3个)
- SupplementaryData9_IPO323dChr18-H3K4.bed:IPO323菌株18号染色体H3K4修饰位点数据
- SupplementaryData10_IPO323dChr18-H3K9.bed:IPO323菌株18号染色体H3K9修饰位点数据
- SupplementaryData11_IPO323dChr18-H3K27.bed:IPO323菌株18号染色体H3K27修饰位点数据
适用场景
- 表观遗传学机制研究:分析组蛋白修饰(H3K27me3、H3K9me3)对病原真菌突变率的调控作用
- 病原真菌进化研究:探究转座子甲基化与突变率的关联,解析真菌基因组进化轨迹
- 环境胁迫响应分析:利用温度胁迫相关数据,研究环境因素对真菌突变率的影响
- 基因组变异验证:基于SNP验证数据,开展病原真菌突变位点的准确性验证与分析
- 实验数据支撑:为真菌表观遗传修饰与突变率相关的学术研究提供原始数据与统计结果支持