EpiSyStem研讨会示例文件集

数据集概述

该数据集为EpiSyStem研讨会提供的示例文件集合,包含17个文件,涵盖测序数据、基因组图谱、可视化图表等多种类型,用于辅助研讨会相关技术内容的演示与实践。

文件详解

  • 主要文件类型及示例:
  • 测序数据文件:demultiplexedR1_10000rows.fastq.gz、demultiplexedR2_10000rows.fastq.gz(.gz格式)
  • 基因组图谱文件:H3K4me3_cluster_6.bw、H3K4me3_cluster_3.bw、H3K4me1_cluster_2.bw(.bw格式,共6个)
  • 比对结果文件:H3K4me3_cluster_6.filtered.bam(.bam格式)及对应索引文件H3K4me3_cluster_6.filtered.bam.bai(.bai格式,共3个)
  • 可视化图表:H3K4me1_cluster_UMAP.pdf、H3K4me3_cluster_UMAP.pdf(.pdf格式)
  • 文本文件:regions_to_filter.txt(.txt格式,包含基因组区域坐标信息)

适用场景

  • 生物信息学培训:作为EpiSyStem研讨会的实践素材,用于演示基因组数据处理流程
  • 表观遗传学分析:辅助理解组蛋白修饰(如H3K4me3、H3K4me1)相关数据的可视化与分析方法
  • 测序数据处理教学:展示FastQ、BAM、BW等常见生物信息学文件格式的应用场景
  • 基因组区域分析:利用regions_to_filter.txt文件学习基因组特定区域的筛选与处理逻辑
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 90.19 MiB
最后更新 2025年12月6日
创建于 2025年12月6日
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