数据集概述
本数据集为欧洲核苷酸档案(ENA)提交ERR15104896的关联元数据,包含Genome in a Bottle项目RNA002样本的测序实验相关数据文件,涉及测序仪器、孔道扫描、吞吐量等多维度信息,支持实验数据的溯源与解析。
文件详解
- 文档类文件
- report_PAM30088_20230526_1733_597e5dcb.md:Markdown格式报告文件
- report_PAM30088_20230526_1733_597e5dcb.json:JSON格式报告文件
- report_PAM30088_20230526_1733_597e5dcb.html:HTML格式报告文件
- 文本类文件
- final_summary_PAM30088_597e5dcb_2b1fa04e.txt:TXT格式,包含仪器、样本、协议等实验基础信息
- sequencing_summary_PAM30088_597e5dcb_2b1fa04e.txt:TXT格式测序汇总文件
- 数据类文件
- throughput_PAM30088_597e5dcb_2b1fa04e.csv:CSV格式,记录测序吞吐量数据
- pore_activity_PAM30088_597e5dcb_2b1fa04e.csv:CSV格式,记录孔道活性数据
- pore_scan_data_PAM30088_597e5dcb_2b1fa04e.csv:CSV格式,含channel(通道)、conductance(电导)等孔道扫描字段
- sample_sheet_PAM30088_20230526_1733_597e5dcb.csv:CSV格式样本表文件
- barcode_alignment_PAM30088_597e5dcb_2b1fa04e.tsv:TSV格式,记录barcode(条形码)、sample_id(样本ID)等比对信息
适用场景
- 基因组测序实验数据溯源与验证
- 纳米孔测序技术参数分析(如孔道活性、吞吐量)
- 欧洲核苷酸档案提交数据的结构化解析研究
- 测序实验元数据标准化存储参考