数据集概述
本数据集为Bockaj, Martini等人2022年发表于《国际分子科学杂志》的研究原始数据,围绕儿童髓母细胞瘤染色体不稳定性特征及其在发育中小脑的耐受性展开,包含研究相关的图表、基因聚类、基因组热图、生存曲线及实验图像等数据文件。
文件详解
该数据集按研究图表分类存储,具体说明如下:
- Figure_1相关文件:
- 基因组热图文件:如MB-1_genomeHeatmap_binsize_1e+06_stepsize_5e+05_refined_curated.pdf,PDF格式,展示不同样本的基因组热图
- 基因映射文件:如All_genes_average_euclidean_LONG_MAP.pdf,PDF格式,呈现基因平均欧氏距离映射结果
- 热图文件:如heatmap_YELLOW_set1_groups_xGR_ward.D_manhattan.pdf,PDF格式,展示特定基因集的聚类热图
- Figure_2相关文件:
- 基因子聚类文件:Orange_Red_CGNP_gene_subclusters_for_DAVID_cytoscape.xlsx,XLSX格式,为DAVID和Cytoscape分析提供CGNP基因子聚类数据
- Figure_3相关文件:
- 实验数据文件:如DNA_repair_low.pzfx、P0_P7_yRay_IR.pzfx等,pzfx格式,记录DNA修复、辐射处理等实验数据
- 实验图像文件:如1.1 P0 t=2 0.5Gy g4.tif,TIFF格式,包含不同剂量辐射处理后的细胞免疫荧光图像
- Figure_4相关文件:
- 生存曲线文件:Kaplan-Meier_survival_curve.pzf,pzf格式,存储Kaplan-Meier生存曲线数据
数据来源
Bockaj, Martini et al. Int. J. Mol. Sciences 2022
适用场景
- 儿童髓母细胞瘤发病机制研究:分析染色体不稳定性在肿瘤发生中的作用
- 发育神经生物学研究:探究发育中小脑对染色体不稳定性的耐受机制
- 肿瘤基因组学分析:基于基因组热图数据研究髓母细胞瘤的基因组特征
- 实验治疗效果评估:利用辐射、药物处理实验数据评估干预手段对染色体稳定性的影响
- 生物信息学方法应用:通过基因聚类、生存曲线数据验证相关分析算法