数据集概述
本数据集为将发表于《Cell Reports Medicine》的论文“儿童COVID-19和多系统炎症综合征(MISC)的中性粒细胞特征”提供支撑,包含论文所需的全部代码、运行代码的补充数据文件及补充材料,可支持研究的复现分析,共含24个文件。
文件详解
- 数据文件(.xlsx,15个)
- 示例文件:Heatmap_Metadata_Tables1+2.xlsx、umap_coordinates.xlsx、HC_vs_other.xlsx、COVID_vs_other.xlsx、LaSalle_Clusters.xlsx、Cardiac_yes_vs_no.xlsx、supplementary-table-S5.xlsx、MISC_vs_COVID.xlsx等
- 内容说明:包含热图元数据表、UMAP坐标、不同分组(健康对照vs其他、COVID-19vs其他、MISCvsCOVID-19等)的分析数据、细胞聚类信息、补充表格等
- 补充材料文件(.avi,3个)
- 示例文件:supplementary-movie-S1.avi、supplementary-movie-S2.avi、supplementary-movie-S3.avi
- 内容说明:论文的补充视频材料
- 基因集文件(.gmt,3个)
- 示例文件:neutrophil_state_gene_sets.gmt、all_gene_sets.gmt、neutrophil_state_gene_sets_ensembl.gmt
- 内容说明:中性粒细胞状态基因集及全基因集数据
- 文档文件(.md、.Rmd,共2个)
- 示例文件:Pediatric_COVID_MISC_Neutrophils.md、Pediatric_COVID_MISC_Neutrophils.Rmd
- 内容说明:项目说明文档、R代码文件
- 基因ID映射文件(.txt,1个)
- 示例文件:Ensembl_to_Symbol.txt
- 内容说明:包含Gene stable ID(基因稳定ID)、Gene name(基因名称)、Gene type(基因类型)等字段的基因ID映射表
数据来源
论文“Neutrophil Profiles of Pediatric COVID-19 and Multisystem Inflammatory Syndrome in Children”(待发表于Cell Reports Medicine)
适用场景
- 儿童感染性疾病研究:分析儿童COVID-19与MISC患者的中性粒细胞特征差异
- 炎症性疾病免疫机制研究:探究中性粒细胞状态在儿童多系统炎症中的作用
- 生物信息学复现分析:基于提供的代码和数据复现论文的分析结果
- 医学论文补充材料支撑:为相关主题的医学论文提供数据参考和可视化材料支持