数据集概述
本数据集包含人鼠骨髓CD45+红细胞抗菌免疫应答特征基因的单细胞蛋白表达数据,通过流式细胞术检测Arginase 1等8种蛋白,辅以细胞因子、基因表达及数据处理代码文件,支持免疫相关研究,共14个文件。
文件详解
- 数据文件(CSV格式,8个)
- 文件名:Eb BM 1.csv、Eb BM 2.csv、Eb BM 3.csv、Eb BM 4.csv、Eb BM 6.csv、Eb BM 8.csv等
- 字段映射:包含Arginase.1、Galectin.3、CD184、CD36、CD45、CD49d、CD71、CD235a等蛋白表达量数据
- 数据文件(XLSX格式,3个)
- 文件名:BioPlex_Cytokines.xlsx、NanoString_Mm_GEX_Filtered.xlsx、NanoString_Hs_GEX.xlsx
- 内容说明:细胞因子数据、小鼠及人类基因表达过滤数据
- 代码文件(IPYNB格式,3个)
- 文件名:Seurat Eb Mm scRNA-seq.ipynb、Seurat Eb Hs Flow.ipynb、Eb Mm NanoString GEX.ipynb
- 内容说明:单细胞RNA-seq及流式数据处理代码
数据来源
标题为“Human and mouse bone marrow CD45+ Erythroid cells have a constitutive expression of antibacterial immune response signature genes”的研究
适用场景
- 免疫基因表达研究:分析人鼠骨髓CD45+红细胞抗菌免疫应答基因表达特征
- 细胞蛋白表达分析:通过流式数据探究目标蛋白在红细胞中的表达水平
- 生物信息学分析:利用代码文件复现或扩展单细胞及基因表达数据处理流程
- 跨物种免疫机制对比:比较人与小鼠红细胞免疫相关基因表达差异