数据集概述
本数据集源自大肠杆菌25年(60,000代)长期进化实验,聚焦Ara−1种群。通过分析每500代冷冻的全种群样本中42个已知突变,重建该种群20,000代内的基因型进化史,揭示选择性清除、克隆干扰及频率依赖交互等进化动力学特征,含2个压缩文件。
文件详解
- 文件名称:
Ara-1_Genotyping-DRYAD.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含Ara−1种群20,000代内42个已知突变的基因型追踪数据,支持重建种群基因型进化历史,分析选择性清除与克隆干扰事件。
- 文件名称:
Ara-1_Frequency_Dependence-DRYAD.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含Ara−1种群内两个遗传分化分支共存及频率依赖交互的相关数据,用于研究分支间竞争排除延迟及交互机制崩溃过程。
数据来源
论文“Adaptation, clonal interference, and frequency-dependent interactions in a long-term evolution experiment with Escherichia coli”
适用场景
- 微生物进化动力学研究:分析选择性清除、克隆干扰等核心进化过程的发生机制与时间特征。
- 频率依赖交互机制分析:探究简单微生物种群中频率依赖关系对种群共存时长的影响。
- 基因型进化历史重建:基于已知突变轨迹还原特定种群的长期基因型演变路径。
- 克隆竞争与分支灭绝研究:解析遗传分化分支的共存条件及最终灭绝的驱动因素。