数据集概述
本数据集记录大肠杆菌在五万代实验进化过程中的细胞大小与形状变化,包含祖先菌株及12个种群在两千、一万和五万代时的静止期细胞体积测量数据,以及五万代指数生长期的补充测量。通过库尔特计数器和显微镜分析细胞体积分布与形态,结合基因组序列数据,揭示细胞形态进化趋势及相关基因变异。
文件详解
- README文档
- 文件名称:README-cell-size-manuscript.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:包含数据集的研究背景、实验方法、数据采集流程及文件说明等核心信息
- 细胞死亡数据集脚本
- 文件名称:Cell-death-dataset-script.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含与细胞死亡相关的数据集及分析脚本
- 细胞壁突变数据集脚本
- 文件名称:Cell-wall-mutations-datasets-script.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含细胞壁突变相关的数据集及分析脚本
- 克隆混合种群完整提交数据
- 文件名称:Clones-mixed-populations-full-submission.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含克隆与混合种群的完整实验数据
- 指数与静止期数据集脚本
- 文件名称:Exponential-stationary-phase-datasets-script.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含指数生长期与静止期的细胞形态数据集及分析脚本
数据来源
论文“Changes in cell size and shape during 50,000 generations of experimental evolution with Escherichia coli”
适用场景
- 微生物进化研究:分析大肠杆菌在长期实验进化过程中细胞大小与形状的变化规律
- 细胞形态遗传学研究:结合基因组数据探究细胞形态相关基因突变的进化机制
- 微生物适应性进化分析:研究细胞大小与适应度的相关性及进化权衡
- 微生物表型可塑性研究:对比不同生长阶段(指数期/静止期)的细胞形态差异
- 实验进化方法论验证:验证长期实验进化研究中细胞形态测量方法的可靠性与重复性