数据集概述
本数据集是陆生腹足类中枢神经系统(CNS)转录组分子资源库eSnail的核心数据,涵盖6种生态入侵性陆生腹足类(含Cochlicella acuta、Helix aspersa等蜗牛及Deroceras invadens等蛞蝓)的CNS转录组测序结果,包含3.68亿高质量读数、41.9万条独特转录本及12.4万条注释转录本,还提供微卫星和单核苷酸变异信息,是陆生腹足类CNS功能研究的综合资源。
文件详解
- 文件名称:esnail.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 字段映射介绍:压缩包内含陆生腹足类CNS转录组核心数据,涵盖原始测序读数、组装的转录本序列、功能注释结果(含GO、KEGG通路、蛋白家族信息)、6.67万微卫星位点及30.47万单核苷酸变异位点数据,具体字段需解压后查看内部文件结构。
数据来源
eSnail数据库(http://soft.bioinfo-minzhao.org/esnail)
适用场景
- 陆生腹足类神经分子生物学研究: 分析CNS转录本的功能注释信息,探究腹足类神经代谢活动及分子功能调控机制。
- 生物防治靶标开发: 挖掘腹足类特异性基因或神经肽,为入侵性陆生腹足类的生物防治策略提供分子靶点。
- 分子标记开发: 利用微卫星和单核苷酸变异数据设计引物,开展腹足类种群遗传学或功能筛选研究。
- 比较转录组分析: 与现有地中海蜗牛Theba pisana的CNS转录组资源对比,分析入侵性腹足类的分子适应性特征。