数据集概述
本数据集为真兽类哺乳动物系统发育基因组学研究数据,包含37个物种的447个核基因全基因组数据,用于解决真兽类哺乳动物系统发育中的冲突问题。通过串联法与多物种溯祖模型的对比分析,揭示基因树异质性对系统发育重建的影响,明确真兽类系统发育关系及根位置。
文件详解
- 文件名称:
README_for_gene447_final.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:包含数据集的说明文档,可能涵盖数据来源、实验设计、分析方法、结果解释等背景信息,用于辅助理解数据集内容。
- 文件名称:
gene447_final.nexus
- 文件格式:NEXUS
- 字段映射介绍:包含37个真兽类哺乳动物物种的447个核基因序列数据,为系统发育分析的核心数据文件,可用于贝叶斯或最大似然法的系统发育树构建。
数据来源
论文“Resolving conflict in eutherian mammal phylogeny using phylogenomics and the multispecies coalescent model”
适用场景
- 系统发育基因组学研究: 用于分析真兽类哺乳动物的系统发育关系,验证串联法与多物种溯祖模型的差异。
- 基因树异质性分析: 研究不完全谱系分选等因素导致的基因树异质性对深层系统发育的影响。
- 生物进化研究: 探讨真兽类哺乳动物的起源、分化及生物地理演化历史。
- 计算生物学方法验证: 测试不同系统发育分析方法(如串联法、溯祖模型)在处理基因组数据时的准确性和稳健性。