数据集概述
本数据集记录法国里昂地区野外白纹伊蚊群体感染基孔肯雅病毒后的感染、传播动力学实验数据，包含病毒剂量梯度暴露后的感染率、传播率等指标，以及基于数据的流行病学模拟结果，为评估病毒在法国本土传播的流行潜力提供数据支持。
文件详解
- 原始数据文件：
- Raw_data_viginier_et_al2023.txt：TXT格式，包含实验剂量、感染天数（daype）、感染率（IR）及置信区间、传播率（TR）等核心实验数据字段
- Data_titer_EIPdyna_final.txt：TXT格式，记录病毒滴度与外潜伏期（EIP）动态数据
- Data_titer_EIPdyna_body_head_final.txt：TXT格式，分蚊虫身体/头部的病毒滴度与EIP动态数据
- Data_CHIKV_RNA_load_saliva.txt：TXT格式，唾液中CHIKV RNA载量数据
- ChikV_Viremia_dynamic.txt：TXT格式，基孔肯雅病毒血症动态数据
- 模拟结果文件：
- R0dist_run5.csv：CSV格式，包含基本再生数（R0）、重复次数（rep）、病毒分离株（isolate）字段
- cumulative_run5.csv：CSV格式，记录时间（t）、病例数（Count）、病例类型（H/M）等模拟传播数据
- Compiled_results_run5.csv：CSV格式，汇总的模拟结果数据
- 代码文件：
- Script_Viginier_et_al_2023.R：R格式，数据处理与分析脚本
- 图表文件：
- FigS1.pdf、FigS3.pdf、Fig2.pdf、Fig3.pdf、Fig5.pdf、TabS1.pdf等9个PDF文件，包含实验结果图表与补充表格
适用场景
- 媒介昆虫病毒学研究：分析白纹伊蚊对基孔肯雅病毒的易感性与传播能力
- 流行病学模拟：基于实验数据验证基孔肯雅病毒在法国本土的流行潜力模型
- 公共卫生风险评估：评估不同病毒暴露剂量下蚊虫传播病毒的时间动态与风险阈值
- 病毒传播动力学研究：探究媒介内病毒感染、扩散、传播各阶段的屏障效应机制
