数据集概述
本数据集是关于法国牛分枝杆菌菌株全基因组测序研究的附录资料，包含6个附录文件，涉及不同基因型菌株的基因组信息、IS6110插入位点及系统发育树，为牛分枝杆菌遗传特征研究提供数据支持。
文件详解
- Annex 1.xlsx：Excel格式，包含87个牛分枝杆菌基因组信息，按聚类颜色标注（如黄色Cluster I、橙色Cluster G等），数据来源于Hauer等2019年研究。
- Annex 2.xlsx：Excel格式，包含187个F7和F15基因型（SB0821、SB0832）菌株基因组信息，部分数据来自Duault等2022年研究，未发表数据标注为NA。
- Annex 3.xlsx：Excel格式，包含227个SB0120-DHV基因型菌株基因组信息，所有数据未发表，"Date of deposit"和"Genbank biosample"字段标注为NA。
- Annex 4.xlsx：Excel格式，包含比利牛斯-大西洋地区SB0821和SB0832菌株的IS6110插入位点信息，基于ISMapper工具和AF2122/97参考基因组分析。
- Annex 5.xlsx：Excel格式，包含SB0120-DHV菌株的IS6110插入位点信息，基于ISMapper工具和Mb3601参考基因组分析。
- Annex 6.PNG：PNG格式，展示300个SB0120-DHV菌株的环状系统发育树，含11个彩色分支及Beast软件计算的后验概率值。
适用场景
- 牛分枝杆菌遗传多样性研究：分析不同基因型菌株的聚类特征与进化关系
- 分子流行病学分析：探究IS6110插入位点在菌株分型中的应用
- 基因组数据整合研究：补充已发表或未发表的牛分枝杆菌基因组信息
- 系统发育分析：验证环状系统发育树构建方法及分支可信度评估
