数据集概述
本数据集围绕反刍动物对草原环境的适应性进化展开,包含基于现生类群特征重建的鲸偶蹄目时间校准分子系统发育树、祖先反刍动物饮食与栖息地特征,以及与草原化石记录结合的系统发育比较分析结果,揭示高冠齿(hypsodonty)进化与饮食、栖息地的关联及缓慢适应性过程。
文件详解
- 补充表格文件:
- SuppTable2c.txt:TXT格式,包含节点、祖先、时间、物种、饮食、栖息地、HI等字段的数据集
- Table2input.txt:TXT格式,表格2的输入数据文件
- ruminants.txt:TXT格式,反刍动物相关数据文件
- Supplementary Table 2. Additional models.pdf:PDF格式,补充表2(附加模型)
- Supplementary Table 1. Calibrations table.pdf:PDF格式,补充表1(校准表)
- 代码文件:
- SLOUCH software 2016.R:R格式,2016版SLOUCH软件代码
- code for supplement.R:R格式,补充材料的代码文件
- 系统发育与BEAST相关文件:
- cetartiodactyla_gtr.xml:XML格式,鲸偶蹄目GTR模型的BEAST输入文件
- BEAST input file.tre:TRE格式,BEAST输入的树文件
- cetartiodactyla_gtr.tre:TRE格式,鲸偶蹄目GTR模型的树文件
适用场景
- 进化生物学研究:分析反刍动物高冠齿进化与饮食、栖息地的适应性关联
- 系统发育学研究:基于时间校准分子系统发育树探究鲸偶蹄目演化时间线
- 古生态学研究:结合草原化石记录与现生类群数据,探讨百万年尺度的缓慢适应过程
- 生物统计学分析:利用SLOUCH等软件模型开展系统发育比较分析