数据集概述
本数据集包含基于14个SSR标记对大熊猫主食竹子(缺苞箭竹复合体)遗传分化的研究数据,涉及39个种群的750个个体。数据显示种群间存在不同程度的遗传多样性,系统发育分析将种群分为两大遗传类群,海拔差异可能是导致分化的关键因素。数据集包含两个文件,用于支持竹子分类学和遗传进化研究。
文件详解
- 文件名称:All_individuals_variation_information_on_14_SSR_markers.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含750个个体在14个SSR标记上的变异信息,支持大熊猫主食竹子种群遗传多样性和分化分析。
- 文件名称:All_individuals_variation_information_CONVERT_all_20200520.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含种群数量(npops=39)、基因座数量(nloci=14)等元数据,以及个体的SSR标记基因型数据(如B0101个体的252、255等标记数值),用于遗传分析软件的直接导入和处理。
数据来源
论文“Altitude difference might contribute to the genetic divergence of giant panda' staple food Bamboo (Fargesia spathacea complex) based on 14 SSR markers”
适用场景
- 竹子分类学研究:验证缺苞箭竹复合体物种的分类有效性,支持物种界定和修订。
- 大熊猫主食竹子遗传多样性分析:评估不同种群的遗传多样性水平,为保护策略制定提供依据。
- 海拔对植物遗传分化的影响研究:分析海拔差异与遗传分化的关联性,探讨生态因子对物种进化的作用。
- 分子生态学研究:利用SSR标记数据开展种群遗传结构、基因流和进化历史的分析。