数据集概述
本数据集为论文补充数据文件3,包含脂肪细胞条件培养基(ACM)中SPE-氯仿组分与SPE-丙酮组分脂质组学分析的XCMS原始数据输出。通过反相HPLC-MS(负离子模式)采集数据并转换为mzdata格式,共含6个文件,用于研究脂肪细胞相关糖皮质激素信号对成纤维细胞功能的调节及炎症关节炎中的变化。
文件详解
- 脂质组学分析原始数据文件
- 文件名称:RP acetone-1 neg.mzdata.xml、RP acetone-2 neg.mzdata.xml、RP acetone-3 neg.mzdata.xml、RP chloroform-1 neg.mzdata.xml、RP chloroform-2 neg.mzdata.xml、RP chloroform-3 neg.mzdata.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:记录反相HPLC-MS(负离子模式)采集的脂质组学原始数据,经XCMS分析后包含质荷比(m/z)、保留时间、倍数变化、p值、强度等核心指标,每个数据点对应1884个分析项。
数据来源
论文“Adipocyte associated glucocorticoid signaling regulates normal fibroblast function which is lost in inflammatory arthritis”(Faust et al.)
适用场景
- 脂质组学差异分析:比较脂肪细胞条件培养基中SPE-氯仿与丙酮组分的脂质表达差异,筛选关键脂质分子
- 炎症关节炎机制研究:探究脂肪细胞糖皮质激素信号对成纤维细胞功能的调节作用及脂质代谢异常的关联
- 生物医药标志物筛选:基于脂质组学数据挖掘炎症关节炎潜在的诊断或治疗靶点
- 代谢组学数据分析方法验证:验证XCMS软件在脂质组学原始数据处理中的应用效果