Federman_et_al_ZENODO_Based_马达加斯加树木辐射演化生物地理起源研究数据

数据集概述

本数据集包含马达加斯加树木辐射演化生物地理起源研究的支持数据，涉及三种系统发育推断场景的树文件、RAxML起始树及BEAST贝叶斯系统发育推断用XML文件。XML文件内含分子数据串联比对，代码脚本可按需获取，用于分析热带森林群落组装机制。

文件详解

• 压缩包文件
• 文件名称：Federman_et_al_ZENODO.zip
• 文件格式：ZIP
• 包含目录及内容：
• ~/trees/：三种系统发育推断的树文件及最大分支可信度树，场景为含化石末端的Canarieae、含化石节点的Canarieae、不含Canarieae化石节点校准的含化石节点Canarieae
• ~/trees/RAxML/：RAxML起始树文件
• ~/xml_files/：BEAST贝叶斯推断用XML文件，内含分子数据串联比对

适用场景

• 生物地理学研究：分析马达加斯加树木辐射演化的生物地理起源及热带森林群落组装机制
• 系统发育分析：利用树文件和XML比对数据开展贝叶斯系统发育推断验证
• 化石校准方法评估：比较不同化石校准策略对系统发育结果的影响
• 演化模型构建：基于生物地理模型数据探究岛屿植物区系的演化历史