分子动力学模拟的分子排列与条纹识别分析工具数据集

数据集概述

该数据集包含“MAFIA-MD”工具，用于分析碳氢化合物反应分子动力学（RMD）模拟中的分子结构。工具可同时处理大量RMD轨迹文件，分析环状结构并生成脂环烃、芳香烃统计，提取SMILES和SDF格式化学信息，还实现条纹间距计算以验证HRTEM图像，含图形用户界面。

文件详解

• 文件名称: MAFIA-MD-1.0.1.zip
• 文件格式: ZIP压缩包（.zip）
• 内容说明: 压缩包内包含“MAFIA-MD”工具的完整文件，该工具为反应分子动力学模拟的后处理程序，支持分析分子排列、识别条纹结构、提取化学信息及统计分析等功能。

适用场景

• 分子动力学模拟分析: 用于碳氢化合物RMD模拟轨迹的分子结构表征与化学信息提取
• 材料科学研究: 验证RMD模拟结果与高分辨率透射电子显微镜（HRTEM）图像的一致性
• 计算化学工具开发: 作为后处理工具参考，优化或扩展分子动力学模拟分析功能
• 碳氢化合物反应研究: 分析反应过程中形成的脂环烃、芳香烃等分子的结构特征与统计规律