数据集概述
本数据集包含FGF9过表达（FGF9-OE）与对照小鼠感染甲型流感病毒（IAV）1天后，经分选的气道上皮细胞RNA测序数据。通过基因表达分析，探究FGF9对呼吸道病毒感染及发病机制的调控作用，涉及干扰素信号、细胞因子表达及病毒嗜性变化等核心内容。
文件详解
该数据集包含21个文件，按类型分类说明如下：
- 结果可视化文件（.svg格式，9个）：
- GeneModel_plot.svg：基因模型可视化图
- Transcript_biotype_plot.svg：转录本生物型分布图表
- EndBias_plot.svg：测序末端偏好性分析图
- Gene_moderated_log2CPM_pearson_correlation_matrix.svg：基因表达量皮尔逊相关矩阵图
- JunctionSaturation_plot.svg：剪接位点饱和性分析图
- Transcript_moderated_log2CPM_spearman_correlation_matrix.svg：转录本表达量斯皮尔曼相关矩阵图
- 基因与转录本表达数据文件（.txt格式，7个）：
- all.gene_CPM_AEC.txt：基因每百万转录本（CPM）表达量数据，含ensembl_gene_id、external_gene_name等字段
- all.transcript_moderated_log2cpm_AEC.txt：转录本标准化log2CPM表达量数据
- all.gene_counts_AEC.txt：基因原始计数数据
- 统计摘要文件（.tsv格式，4个）：
- gene_summary.tsv：基因水平统计摘要，含Detected特征数、Total.Counts等字段
- Transcript_biotype_summary.tsv：转录本生物型统计摘要，含各样本转录本类型分布
- Gene_biotype_summary.tsv：基因生物型统计摘要
- transcript_summary.tsv：转录本水平统计摘要
- 其他文件：
- README_file.txt.txt：数据集说明文档
- summary_of_services.html：服务汇总报告
数据来源
Washington University in St. Louis
适用场景
- 分子生物学研究：分析FGF9对气道上皮细胞基因表达谱的影响
- 病毒学研究：探究FGF9调控呼吸道病毒感染及发病机制的分子机制
- 免疫学研究：解析FGF9对干扰素信号通路及免疫细胞浸润的调控作用
- 转录组学分析：研究FGF9-OE小鼠感染后病毒嗜性变化的基因表达基础
