数据集概述
本数据集包含雌雄异株榕属植物与榕小蜂的基因组序列数据,用于研究两者间的物种特异性及传粉者共享机制。通过基因组测序、线粒体DNA序列及微卫星数据分析,探究台湾三种榕小蜂的基因分化与传粉行为,为协同进化理论提供实证支持。
文件详解
- 压缩文件(Archive files)
- 文件名称:t50.zip、t100.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容说明:包含基因组相关数据的压缩包,具体内容需解压后查看
- 说明文档(Document files)
- 文件名称:README_for_t50.txt、README_for_t100.txt
- 文件格式:TXT
- 内容说明:记录ddRAD-seq位点比对信息,包括聚类阈值(85%/92%)、最小样本数(2/65/92)等参数
- 基因序列文件(Other files)
- 文件名称:Bnip_CO1_2_140710_cut_name.fas.unique_haplotypes、Bnip_cytB_140710_cut_name.fas.unique_haplotypes
- 文件格式:.unique_haplotypes
- 内容说明:榕小蜂(Blastophaga nipponica)的CO1和cytB基因单倍型数据
数据来源
论文“Genome-wide sequence data suggest the possibility of pollinator sharing by host shift in dioecious figs (Moraceae, Ficus)”
适用场景
- 植物-传粉者协同进化研究: 分析榕属植物与榕小蜂的基因分化模式,验证协同进化理论
- 传粉者共享机制分析: 探究台湾榕小蜂跨物种传粉的遗传基础与生态适应
- 物种特异性验证: 通过基因组数据验证榕属植物与传粉者间的物种特异性关系
- 种群遗传学研究: 利用微卫星数据解析榕小蜂及宿主植物的种群结构与遗传多样性
- 分子系统发育分析: 基于线粒体DNA序列构建榕小蜂的系统发育树,研究物种演化关系