数据集概述
本数据集包含通过FLiPPR及配套Python脚本处理的有限蛋白水解（LiP）质谱数据结果，涉及B_CEREUS和E_COLI（PXD025926）两种样本，涵盖肽段、蛋白质摘要、切割位点数据及对应分析代码，共8个文件，用于蛋白质组学相关研究。
文件详解
- 数据文件（.xlsx格式，共6个）
- B_CEREUS_FLiPPR_Peptides.xlsx：B_CEREUS样本的肽段数据
- B_CEREUS_FLiPPR_Protein_Summary.xlsx：B_CEREUS样本的蛋白质汇总数据
- E_COLI_PXD025926_FLiPPR_Protein_Summary.xlsx：E_COLI（PXD025926）样本的蛋白质汇总数据
- E_COLI_PXD025926_FLiPPR_Peptides.xlsx：E_COLI（PXD025926）样本的肽段数据
- B_CEREUS_FLiPPR_Cut_Sites.xlsx：B_CEREUS样本的蛋白切割位点数据
- E_COLI_PXD025926_FLiPPR_Cut_Sites.xlsx：E_COLI（PXD025926）样本的蛋白切割位点数据
- 代码文件（.ipynb格式，共2个）
- FLiPPR_Fig_05.ipynb：生成Figure 05的分析代码
- FLiPPR_Fig_04.ipynb：生成Figure 04的分析代码
适用场景
- 蛋白质组学分析：用于B_CEREUS和E_COLI样本的肽段鉴定、蛋白质表达及切割位点研究
- 质谱数据处理方法验证：验证FLiPPR工具在有限蛋白水解质谱数据处理中的应用效果
- 蛋白质结构研究：通过蛋白切割位点数据推断蛋白质构象变化
- 生物信息学代码复用：参考.ipynb文件中的分析流程，复现或优化蛋白质组学数据分析步骤
