数据集概述
本数据集为蝇类生命树演化辐射研究的系统发育基因组学数据，包含149个蝇科的分子（核基因、线粒体基因组）与形态学数据，用于揭示蝇类三次快速辐射事件及食性转变历史，支持昆虫演化、基因组比较等研究，共36份文件。
文件详解
- 基因序列文件（.fasta格式）
- 部分文件名：CAD_noIntrons.alnFLYTREE.fasta、GART_alnFLYTREE.fasta、Nad1-alnFLYTREE.fasta、PEPCK_alnFLYTREE.fasta、SNF_alnFLYTREE.fasta、G6PD_alnFLYTREE.fasta、Nad4-alnFLYTREE.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：包含核基因（如CAD、GART、G6PD）、线粒体基因（如Nad1、Nad4）的多序列比对数据，用于系统发育分析
- 系统发育分析文件（.nex格式）
- 部分文件名：fly2.28s.nex、28S.aln5.22.09.nex
- 文件格式：NEXUS
- 字段映射介绍：包含28S核糖体RNA等基因的比对数据，用于构建系统发育树
- 压缩包文件（.zip格式）
- 部分文件名：FLYTREEmitoGeneAln.zip、FLYTREENuclearGenes_ALN.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：分别压缩了线粒体基因、核基因的多序列比对文件集合
- 注释文件（.xls格式）
- 文件名：FLY dataset annotations.xls
- 文件格式：XLS
- 字段映射介绍：蝇类数据集的注释信息，可能包含样本分类、基因对应关系等元数据
- 文本文件（.txt格式）
- 文件名：Textnames.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含科、种等分类信息及基因（28S、cad、tpi等）、外类群等数据列标题，如Micropterigidae科Micropterix calthella种的基因对应信息
数据来源
论文“Episodic radiations in the fly tree of life”
适用场景
- 昆虫系统发育研究: 利用基因序列数据构建蝇类生命树，分析演化关系与分类地位
- 生物演化辐射事件分析: 研究蝇类三次快速辐射的时间节点（2.2亿年、1.8亿年、6500万年）及驱动因素
- 基因组比较研究: 对比核基因与线粒体基因数据，探究不同基因在演化分析中的应用价值
- 昆虫食性转变研究: 结合系统发育结果，分析蝇类演化中吸血、植食、寄生等生活史转变的历史
- 生物信息学方法验证: 测试多基因联合分析、形态学与分子数据整合在系统发育研究中的效果
