数据集概述
该数据集包含FMP和N-FMP与FAPα的分子对接模拟数据，旨在揭示FMP较长自降解连接子提升对FAPα响应性的机制。通过MolAICal 1.3软件进行模拟，对比两者与FAPα的氢键相互作用差异，验证FMP更优的酶动力学特性。
文件详解
- 文档与说明文件：
- README.md：Markdown格式，数据集概述文档
- MolAICal_Software_Operation_Manual-1.pdf、MolAICal_Software_Operation_Manual-2.pdf：PDF格式，MolAICal软件操作手册
- conf.txt：TXT格式，对接模拟配置文件，包含受体文件、中心坐标、尺寸等参数
- 结构文件：
- FMP.pdb、N-FMP.pdb、1z68.pdb：PDB格式，FMP、N-FMP分子及FAPα（PDB代码1Z68）的结构文件
- FMP.pdbqt、N-FMP.pdbqt、1z68.pdbqt：PDBQT格式，用于分子对接的结构文件
- 日志文件：
- FMP.log、N-FMP.log：LOG格式，FMP和N-FMP对接模拟日志文件
适用场景
- 药物化学研究：分析分子结构与酶活性的关系
- 分子动力学模拟：验证自降解连接子对酶动力学的影响机制
- 蛋白质-配体相互作用研究：探究氢键作用对分子亲和力的影响
- 生物信息学分析：复现和扩展FAPα相关分子对接模拟实验
