FtsEX非依赖型调控棒状杆菌目RipA介导细胞分离数据集

数据集概述

本数据集为Gaday等人关于"FtsEX非依赖型调控棒状杆菌目RipA介导细胞分离"研究的支持数据，包含用于系统发育分析的序列比对、修剪文件、系统发育树及注释文件，共四个文件。

文件详解

• Rips.aln：序列比对文件，格式未注明，为系统发育重建前的原始比对数据
• Rips.trim：修剪后的序列比对文件，格式未注明，用于系统发育重建
• Rips.treefile：Newick格式系统发育树文件，对应研究中的图1A和图S1
• Rips.txt：文本格式注释文件，用于在iTol平台重命名系统发育树标签，包含序列ID与物种分类的映射关系（如CKG74673.1对应白喉棒状杆菌）

数据来源

Gaday等人的研究手稿

适用场景

• 微生物学研究：分析棒状杆菌目RipA蛋白的系统发育关系
• 细菌细胞生物学：探究FtsEX非依赖型细胞分离机制的进化保守性
• 生物信息学分析：验证系统发育重建方法在细菌功能基因研究中的应用
• 分子进化研究：比较不同棒状杆菌物种间细胞分裂相关基因的序列变异