数据集概述
本数据集围绕复活节彩蛋象鼻虫(Pachyrhynchus属)斑点演化与米勒拟态展开研究,通过分析超一万个UCE基因座,揭示近缘物种间的系统发育关系,证实同域物种的拟态斑纹多由趋同演化形成,并推测其受正频率依赖选择驱动。
文件详解
- 说明文档与方法文件:
- README.txt:TXT格式,介绍数据用途与文件说明
- Supplemental_Methods.docx:DOCX格式,补充研究方法细节
- 补充图表文件:
- Supplementary_Figure_legends.docx:DOCX格式,补充图表图例说明
- Supplementary_Figure_S1.pdf至Supplementary_Figure_S5.pdf:共5个PDF文件,包含研究相关的补充图表(如UCE基因座分区结果条形图等)
- 补充表格文件:
- Supplemental_Table_S1_final.txt:TXT格式,包含样本读取数、UCE数量及标本馆存放信息
- Supplemental_Table_S2.docx至Supplemental_Table_S5.docx:共4个DOCX格式补充表格
- 序列与分析文件:
- pachy-v2-master-probe-list-DUPE-SCREENED.fasta:FASTA格式,探针列表序列文件
- concat_for_mcmc_tree3.zip:ZIP压缩包,包含用于mcmctree分析的串联数据文件(如phylip格式、nexus格式及分区列表)
- Pachyrhynchus_BioGeoBEARS_results.zip:ZIP压缩包,生物地理分析结果文件
适用场景
- 进化生物学研究:分析拟态系统中趋同演化的遗传机制与驱动因素
- 系统发育基因组学研究:探究UCE基因座在近缘物种系统发育关系解析中的应用
- 生态学研究:研究正频率依赖选择对物种表型演化的影响
- 生物地理学研究:结合生物地理分析结果探讨物种分布格局的形成机制