佛罗里达黄群藻目研究数据集

数据集概述

该数据集包含佛罗里达黄群藻目(金藻纲)研究相关的基因序列比对数据,涉及核SSU rDNA、核LSU rDNA、质体LSU rDNA、质体rbcL、质体psaA等多个基因的比对结果,以及用于贝叶斯系统发育推断的最终串联比对文件,共6个文件。

文件详解

  • 基因序列比对文件(.fas格式,共5个):
  • SSU_alignment_mafft.fas:核SSU rDNA基因序列比对结果
  • LSU_alignment_mafft.fas:核LSU rDNA基因序列比对结果
  • ptLSU_alignment_mafft.fas:质体LSU rDNA基因序列比对结果
  • psaA_alignment_mafft.fas:质体psaA基因序列比对结果
  • rbcL_alignment_mafft.fas:质体rbcL基因序列比对结果
  • 串联比对文件:
  • concatenated.nex:.nex格式,用于贝叶斯系统发育推断的最终串联比对数据

适用场景

  • 藻类系统发育研究:用于黄群藻目物种的亲缘关系与分类学分析
  • 分子进化分析:探究黄群藻目核基因与质体基因的进化模式
  • 生物多样性研究:辅助佛罗里达地区黄群藻目新分类单元的鉴定与描述
  • 基因序列比对方法验证:作为测试数据评估不同序列比对工具的效果
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.17 MiB
最后更新 2025年11月27日
创建于 2025年11月27日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。