数据集概述
本数据集为论文“Color and near-infrared reflectance covary in distinct ways across taxa”的复现数据,包含物种颜色及近红外反射率相关的全量数据集、多类群系统发育树文件,以及用于复现研究的R脚本,可支持跨类群反射率相关性分析,共含9个文件。
文件详解
- 代码文件
- 文件名称:Comparative_RScript.Rmd
- 文件格式:Rmd
- 字段映射介绍:用于复现研究工作的R脚本文件
- 数据集文件
- 文件名称:total_dataset.csv、total_dataset.xlsx
- 文件格式:CSV、XLSX
- 字段映射介绍:包含animal(动物)、N(样本量)、ID(编号)、Subspecies(亚种)、B2.TOT(总反射率)、B2.UV(紫外反射率)、B2.VIS(可见光反射率)、B2.NIR(近红外反射率)、class(类群)、Spectrophotometer(分光光度计)等字段
- 系统发育树文件
- 文件名称:crocodylia_species.nwk、insect_species_jon.nwk、mammals.tree、Phasar.nwk、testudines_species.nwk
- 文件格式:NWK、tree
- 字段映射介绍:分别为鳄目、昆虫、哺乳动物、竹节虫与蜘蛛、龟鳖目物种的系统发育树文件
- 附录文件
- 文件名称:AppendixS3.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:含4162种有鳞目及10种外类群物种的时间校准系统发育树信息
数据来源
论文“Color and near-infrared reflectance covary in distinct ways across taxa”(审稿中)
适用场景
- 跨类群反射率相关性分析: 研究不同物种颜色与近红外反射率的关联模式
- 物种光谱特征研究: 分析物种紫外、可见光、近红外反射率的差异及影响因素
- 系统发育与性状关联分析: 结合系统发育树数据,探究反射率性状的演化规律
- 生物研究复现验证: 复现Goldenberg等关于物种反射率相关性的研究结论