数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了npr-8(tm1553)X突变株(FX1553)成虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM琼脂培养基中进行,使用tierpsy软件追踪线虫行为,包含视频原始数据、特征提取数据及标准化格式数据,共3个文件。
文件详解
- 行为追踪数据文件:
- 文件名称:npr-8 (tm1553) on food L_2010_01_25__12_15_2763.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为追踪的原始数据,包含视频帧对应的线虫骨架分割信息等基础数据
- 行为特征数据文件:
- 文件名称:npr-8 (tm1553) on food L_2010_01_25__12_15_2763_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储提取的线虫行为特征数据,基于原始追踪数据计算生成
- 标准化行为数据压缩包:
- 文件名称:npr-8 (tm1553) on food L_2010_01_25__12_15_2763.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含采用wcon格式标准化的线虫行为数据,便于跨平台共享与分析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析npr-8基因对秀丽隐杆线虫觅食、移动等行为的调控作用
- 行为学实验方法验证:基于标准化实验流程(如30分钟适应期、tierpsy追踪)验证线虫行为实验的可重复性
- 行为特征提取算法优化:利用原始追踪数据与特征数据,优化线虫行为特征提取模型
- 神经生物学机制研究:结合基因背景与行为数据,探究npr-8相关神经通路对行为的影响机制