数据集概述
该数据集聚焦柑橘属植物的生物活性物质，收集并分析其化学空间特征，通过结构相似性网络探究与慢性静脉疾病（CVD）相关的化合物，为相关治疗研究提供数据支持。
文件详解
- 化合物基础数据文件：
- Citrus.csv：CSV格式，包含lotus_id、SMILES、DOI、分类学信息等柑橘化合物核心数据
- Citrus_Citrus_extended.csv：CSV格式，扩展版柑橘化合物数据
- Lotus_name_index_annotation.csv：CSV格式，Lotus数据库化合物名称索引与注释
- Citrus_DB_compounds_Similarity_0.85.csv：CSV格式，相似度阈值0.85的柑橘化合物相似性数据
- Citrus.sdf：SDF格式，柑橘化合物结构数据文件
- NPCLASSIFIER.tsv：TSV格式，包含smiles、class_results（如Flavones）、superclass_results（如Flavonoids）等化合物分类数据
- 慢性静脉疾病相关文件：
- List of similar to CVD.xlsx：XLSX格式，与CVD相关的相似化合物列表
- 可视化文件：
- SimNetwork-0-high-01.png：PNG格式，相似性网络可视化图
- SimNetwork-0-high-01_BW-01.png：PNG格式，相似性网络黑白可视化图
- 其他文件：
- MN-2.cys：CYS格式，可能为网络分析相关文件
数据来源
Lotus Natural Products database（https://lotus.naturalproducts.net）
适用场景
- 柑橘属植物生物活性物质的化学空间分析
- 慢性静脉疾病潜在治疗化合物的筛选研究
- 天然产物结构相似性网络构建与可视化分析
- 黄酮类等柑橘化合物的分类与功能研究
