肝细胞癌肿瘤内血管周围免疫微环境空间图谱数据集

数据集概述

本数据集包含肝细胞癌患者成像质谱流式(IMC)数据的分析结果,涉及肿瘤、侵袭边缘及非肿瘤组织区域的细胞空间分布与聚类信息,辅以患者临床详情,为研究肝癌肿瘤微环境空间特征提供数据支持。

文件详解

  • 文件名称:segmented.cell.data.csv
  • 文件格式:CSV
  • 字段说明:
  • 基础信息:Patient(患者)、Sample(样本条码)、Group(组织类型:NT/IM/T)、ROI(感兴趣区域)
  • 空间坐标:x、y(样本坐标)
  • 聚类信息:simprof_cluster(最终聚类结果)、Xshift_Cluster(初始聚类)
  • 组织参数:Area_um2(ROI面积,平方微米)、Area_mm2(ROI面积,平方毫米)、Batch(组织芯片批次)
  • 标记物数据:含Vimentin、CD57等标记物的 arcsine 转换后信号强度(字段名以“_asinh_rescaled”结尾)
  • 文件名称:Clinical_details.pdf
  • 文件格式:PDF
  • 内容说明:与IMC数据关联的患者信息文档

适用场景

  • 肝癌肿瘤微环境空间异质性研究
  • 血管周围免疫细胞群落特征分析
  • 肿瘤侵袭边缘与非肿瘤组织的免疫状态对比
  • 肝细胞癌临床病理参数与空间细胞分布的关联分析
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 780.9 MiB
最后更新 2025年12月7日
创建于 2025年12月7日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。