数据集概述
本数据集为"高糖食物加剧抗生素诱导的微生物组损伤"研究的补充表格,包含微生物组样本测序数据、患者营养摄入数据、营养与微生物组关联数据、药物暴露数据及STORMS检查表,支撑研究的方法学与结果验证。
文件详解
- Data_S1_NCBI_accession_sampleid.xls:Excel文件,含2个工作表
- Sheet1:人类微生物组样本ID与扩增子测序 accession号映射
- Sheet2:小鼠微生物组样本ID、实验编号、处理方案等元数据及SRA accession号
- Data_S2_patients_nutrition_intake.csv:CSV文件,含患者匿名饮食数据,字段包括pid、Meal、Food_NSC、fdrt、Unit、Por_eaten、Food_code、description、总热量、宏量营养素(蛋白质、脂肪、糖等)、脱水重量等
- Data_S3_nutrition_microbiome_correlation.csv:CSV文件,含食物组摄入(如鸡蛋、蔬菜)、临床变量(如调节强度、抗生素暴露)、微生物组Alpha多样性(Simpson倒数指数)等用于贝叶斯建模的汇总数据
- Data_S4_Medication_Exposures_in_the_Two_Days_Prior_to_Stool_Sample_Collection.csv:CSV文件,含粪便样本采集前48小时药物暴露数据,字段包括sampleid、pid、sdrt、药物类别、名称、给药途径、研究特异性抗菌分类(广谱抗生素、氟喹诺酮类等)
- STORMS_checklist_filled_out_2025-01-07v2.pdf:PDF文件,已填写的微生物组研究标准化STORMS检查表(版本1.03)
适用场景
- 微生物组研究:分析抗生素与高糖饮食对人/小鼠肠道微生物组的联合影响
- 临床营养学:探究患者营养摄入(尤其是糖)与微生物组损伤的关联
- 药物流行病学:评估不同类别抗菌药物对肠道微生物组的短期影响
- 微生物组研究方法学:验证STORMS标准在临床微生物组研究中的应用
- 统计建模:基于贝叶斯模型分析营养、药物与微生物组多样性的相关性