高通量扩增子测序_麝香鼠微卫星短串联重复序列数字片段分析数据

数据集概述

本数据集基于高通量扩增子测序技术,对180个麝香鼠样本的12个微卫星位点进行基因分型,对比传统毛细管电泳技术,分析其在等位基因识别精度、扩增 artifacts、长度同源性等方面的优劣,包含基因型数据及分析说明文件,共4个文件。

文件详解

  • README_for_OzHistograms.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:包含数据说明信息,预览内容显示有ID、MuskratID、Site1、Site2等字段,记录样本编号、麝香鼠ID及采样位点等基础信息。
  • README_for_finalGenotypes.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:基因型数据说明文件,用于解释finalGenotypes.txt的内容结构。
  • OzHistograms.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:压缩文件,推测包含微卫星位点的等位基因频率分布直方图相关数据。
  • finalGenotypes.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:记录麝香鼠基因型数据,包含MuskratID(麝香鼠ID)、Loc(位点)、Allele(等位基因)及Oz06b、Oz08b等12个微卫星位点的等位基因分型结果(如Oz06b_167_A)。

适用场景

  • 分子生态学研究: 分析麝香鼠种群的遗传结构、基因多样性及种群分化。
  • 基因分型技术对比: 评估高通量测序与传统毛细管电泳在微卫星基因分型中的性能差异。
  • 微卫星数据分析方法优化: 为开发序列感知的微卫星等位基因识别与分析程序提供数据支持。
  • 野生动物种群监测: 利用基因型数据开展麝香鼠种群的亲缘关系、扩散模式等研究。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.89 MiB
最后更新 2026年2月8日
创建于 2026年2月8日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。