gapseq_Based_124种原养型细菌基因组代谢网络重建数据

数据集概述

本数据集包含124种可自养合成20种蛋白质氨基酸的细菌基因组的gapseq代谢网络重建结果，通过反应与通路预测、转运体预测、草稿网络构建、培养基预测及间隙填充等流程生成，因3个基因组在NCBI不可用未纳入，共1个压缩文件。

文件详解

• 文件名称：Gapseq_models.zip
• 文件格式：ZIP
• 字段映射介绍：压缩包包含124种原养型细菌基因组的代谢网络重建模型文件，具体字段需解压后查看，但根据重建流程推测包含反应、转运体、通路、培养基及间隙填充相关的代谢网络结构与参数信息。

数据来源

论文（doi: 10.1038/s41559-022-01936-3）

适用场景

• 微生物代谢网络研究：分析124种原养型细菌的基因组规模代谢网络结构与功能特性
• 代谢通路预测验证：基于gapseq流程结果验证细菌代谢通路的完整性与准确性
• 微生物培养基优化研究：结合培养基预测结果探索细菌生长的营养需求与条件
• 基因组功能注释补充：通过代谢网络重建补充细菌基因组的功能注释信息