数据集概述
本数据集围绕三刺鱼(Gasterosteus aculeatus)的性别特异性代际可塑性展开,通过独立或联合操控亲代(母本/父本)的捕食风险暴露,分析其对不同性别子代表型(反捕食性状、脑基因表达、存活)的影响,探索亲代与子代性别在代际可塑性中的作用机制。
文件详解
- 行为学实验数据(Dryad-_Behavioral_Assays.txt)
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含ID、Clutch( clutch编号)、Expday(实验日)、Mom/Dad(亲本ID)、Dadtreat/Momtreat(亲本处理)、Dayschasedmom(母本被追逐天数)、Dayssincehatched(孵化后天数)、Sex(子代性别)、Observer(观察者)、Timeemerge(出现时间)、Observation(观察阶段)、Diffsect(差异截面数)、Totalsect(总截面数)、Frozen(是否冷冻)、Mass(质量)、SL(体长)等行为与形态学参数。
- 鳃盖搏动数据(Dryad-_Opercular_beats.txt)
- 文件格式:TXT
- 内容说明:记录子代鳃盖搏动相关数据,反映生理应激反应。
- 趋暗性实验结果(Dryad-_Scototaxis_results.txt)
- 文件格式:TXT
- 内容说明:记录子代趋暗性行为测试结果,评估焦虑程度。
- 捕食实验存活数据(Dryad-_Pred_Assays_Survival.txt)
- 文件格式:TXT
- 内容说明:记录子代在活体捕食者暴露下的存活情况数据。
- WGCNA分析补充材料(Supplementary_material-_WGCNA.xlsx)
- 文件格式:XLSX
- 内容说明:包含加权基因共表达网络分析(WGCNA)相关数据。
- 转录组测序读数摘要(Supplementary_material-_TGP_ReadSummary.xlsx)
- 文件格式:XLSX
- 内容说明:记录转录组测序的读数统计信息。
- 差异表达基因数据(Supplementary_material-_DEGs.xlsx)
- 文件格式:XLSX
- 内容说明:包含子代脑基因差异表达分析结果。
数据来源
论文“Sex-specific intergenerational plasticity I: maternal and paternal effects on sons and daughters”
适用场景
- 生态遗传学研究:分析亲代环境暴露对不同性别子代表型的代际传递效应。
- 行为生态学分析:利用行为学实验数据探索子代反捕食行为的性别特异性差异。
- 分子生态学研究:通过基因表达数据解析亲代处理对不同性别子代脑转录组的调控机制。
- 进化生物学研究:探究性别在代际可塑性进化中的作用,验证亲代-子代性别匹配的适应性假设。
- 水生生物应激响应研究:基于存活数据与生理指标,分析捕食风险下的代际应激传递规律。