数据集概述
本数据集为壁虎miRNA影响肝癌预后的调控网络研究补充资料,包含小RNA测序及生物信息学分析结果。通过筛选壁虎miRNA表达数据,构建miRNA-mRNA跨物种调控网络,识别出miR-100-5p等关键miRNA及EZH2等靶基因,结合免疫浸润分析探究其与肝癌进展的关联,共含7个文件。
文件详解
- 文档类文件(.docx格式,共6个)
- 文件名称:《Supplementary Table 1. Proportional hazards hypothesis testing for univariate cox analysis.docx》《Supplementary Table 2. 15 target genes were found to be significantly upregulated in the regulatory network.docx》《Supplementary Table 3. Downstream 38 target genes identified by univariate cox regression analysis model were associated with prognosis.docx》《Supplementary Table 4. The ranked data after transformation of sample expression.docx》《Supplementary Table 5. The results of Spearman's rank correlation coefficient.docx》《Supplementary Figure 1. Linearity assumption testing for univariate cox regression models.docx》
- 内容说明:包含单因素Cox分析比例风险假设检验结果、调控网络中显著上调的靶基因列表、预后相关靶基因、样本表达转换后的排序数据、Spearman秩相关系数结果、Cox回归模型线性假设检验图等补充表格和图表
- 说明文件(.txt格式,共1个)
- 文件名称:《Read_me_data.txt》
- 内容说明:数据集内容及结果解释说明,提示所有文档为期刊论文的补充材料
数据来源
论文“Small RNA sequencing explores a potential regulatory network mediated by Gecko miRNA affecting the prognosis of hepatocellular carcinoma”
适用场景
- 肝癌预后分子机制研究:分析壁虎miRNA-mRNA调控网络对肝癌进展的影响
- 中药抗肿瘤作用机制探索:探究壁虎活性成分(miRNA)的跨物种调控作用
- 生物信息学网络构建:基于测序数据构建miRNA-mRNA调控网络模型
- 免疫浸润关联分析:研究调控网络与免疫细胞丰度的相关性
- 预后生物标志物筛选:识别与肝癌预后相关的关键miRNA及靶基因
- 中医药现代化研究:为中药(壁虎)的抗肿瘤作用提供分子生物学证据支持