数据集概述
本数据集为论文“Genes, geology, and germs: gut microbiota across a primate hybrid zone are explained by site soil properties, not host species”的配套数据，包含14个狒狒种群的肠道菌群、环境元数据、宿主遗传及地理距离等信息，用于探究灵长类杂交区肠道菌群的影响因素，核心发现为土壤特性而非宿主物种是菌群差异的主要解释因素。
文件详解
- 环境元数据文件
- 文件名称：environmental_metadata.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含14个狒狒种群的13项环境变量信息
- 肠道菌群OTU表文件
- 文件名称：otu_table_no_singletons_CSS_transformed.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：去除单例OTU并经CSS标准化转换的菌群OTU表，含OTU_ID及各样本的菌群丰度数据
- 补充表格文件
- 文件名称：Grieneisen_etal_SupplementaryTables.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：论文相关的补充表格数据
- 植被 Bray-Curtis 距离文件
- 文件名称：vegetation_bray-curtis.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：不同种群间植被群落的Bray-Curtis距离矩阵
- 杂交分数文件
- 文件名称：hybrid_score.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含种群、样本及对应的杂交分数数据
- 种群FST文件
- 文件名称：population_FST.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：狒狒种群间的遗传分化FST数据
- 亲缘关系文件
- 文件名称：lynch_ritland_relatedness.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：基于Lynch-Ritland方法计算的宿主亲缘关系数据
- 地质学 Bray-Curtis 距离文件
- 文件名称：geology_bray-curtis.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：不同种群间地质特征的Bray-Curtis距离矩阵
- 地理距离矩阵文件
- 文件名称：geographic_distance_matrix_in_km.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：各种群间的地理距离矩阵（单位：千米）
数据来源
论文“Genes, geology, and germs: gut microbiota across a primate hybrid zone are explained by site soil properties, not host species”
适用场景
- 灵长类肠道微生物组研究: 分析杂交区狒狒肠道菌群的组成及分布特征
- 环境因素对菌群的影响分析: 探究土壤特性、植被等环境变量与肠道菌群的关联
- 宿主遗传与菌群关系研究: 验证宿主遗传分化、亲缘关系对肠道菌群的影响
- 微生物生态地理学分析: 结合地理距离与菌群数据，研究微生物的地理分布模式
- 杂交区生物特性研究: 利用杂交分数数据，分析杂交程度与肠道菌群的潜在关联
