数据集概述
本数据集为GENETEX手稿配套的一致性率数据，包含GENETEX工具处理临床基因组数据（CGD）时与人工抽象结果的一致性率评估数据，以及工具使用说明文档。GENETEX是一款用于从电子健康记录（EHR）中挖掘基因组报告并导入REDCap®的R包与Shiny应用，数据集支持验证该工具的准确性与效率。
文件详解
- 文件名称：GENETEX_README.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：GENETEX工具的使用说明文档，可能包含工具功能、安装步骤、操作指南等内容。
- 文件名称：GENETEX_Agreement_Rates.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含record_id（记录ID）、DMM.Breast（乳腺DMM）、Breast（乳腺）、SZS.Breast（乳腺SZS）、DMM.Lung（肺DMM）、Lung（肺）、SZS.Lung（肺SZS）、DMM.Oncopanel（肿瘤 panel DMM）、Oncopanel（肿瘤 panel）、SZS.Oncopanel（肿瘤 panel SZS）、DMM.Prostate（前列腺DMM）、Prostate（前列腺）、SZS.Prostate（前列腺SZS）、DMM.Snapshot（Snapshot DMM）、Snapshot、SZS.Snapshot（Snapshot SZS）、DMM.CLL（CLL DMM）、CLL、SZS.CLL（CLL SZS）、DMM.NSCLC（NSCLC DMM）等字段，记录不同类型临床基因组数据的一致性率相关评估结果。
适用场景
- 生物信息学工具评估: 验证GENETEX工具处理临床基因组数据的准确性与一致性率。
- 临床数据处理效率研究: 分析GENETEX工具与人工抽象临床基因组数据的时间对比，评估工具效率。
- 电子健康记录数据挖掘研究: 探索从EHR中提取结构化临床基因组数据的方法与工具应用。
- 临床研究数据管理: 支持REDCap®平台导入临床基因组数据的流程优化与验证。
