GenEvaPa通用蒸发模拟工具包

数据集概述

该数据集包含GenEvaPa工具包，这是一个基于Python和MDAnalysis开发的通用蒸发模拟工具，用于分子动力学模拟中溶剂分子的随机删除，可控制蒸发速率并保留溶质溶剂化壳，无需修改现有软件。

文件详解

• 文件名称：GenEvaPa-main.zip
• 文件格式：ZIP压缩包
• 内容说明：包含GenEvaPa工具包的完整代码与资源，用于在分子动力学模拟中实现蒸发过程建模，支持迭代处理轨迹文件、控制溶剂删除数量及速率，需配合Gromacs等软件使用

适用场景

• 分子动力学模拟研究：用于蛋白质、小分子等体系的溶剂蒸发过程建模
• 计算生物学分析：辅助研究溶质-溶剂相互作用及溶剂化壳结构变化
• 模拟工具开发：作为通用蒸发模拟模块集成到现有分子动力学工作流中
• 计算化学教学：演示分子动力学中溶剂效应与蒸发过程的模拟方法