数据集概述
本数据集为德保矮马群体体型选择机制研究的配套数据，包含96匹中国马的SNP基因分型数据，涉及65157个位点。通过与其他中国马群体比较，揭示德保矮马独立选择小体型的遗传基础，重点关注HMGA2和TBX3等候选基因的选择信号，为马体型进化研究提供遗传数据支持。
文件详解
- 文件名称：README_for_96_Chinese_horse.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：数据集说明文档，包含数据来源（Genome Biology and Evolution论文）、数据内容（SNP原始数据及位点信息）、文件清单及格式说明。
- 文件名称：96_Chinese_horse.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：96匹中国马的SNP基因分型数据表格，包含样本个体信息及65157个位点的基因型数据。
- 文件名称：96_Chinese_horse.ped
- 文件格式：PED
- 字段映射介绍：PLINK格式的基因型数据文件，包含样本家系信息、个体ID、表型数据及各SNP位点的基因型（采用PLINK标准格式，参考Purcell et al. 2007）。
- 文件名称：96_Chinese_horse.map
- 文件格式：MAP
- 字段映射介绍：PLINK格式的位点信息文件，包含SNP位点的染色体编号、物理位置等基本信息，与PED文件配套使用。
数据来源
Genome Biology and Evolution论文：Kader A, Li Y, Dong K, et al. Population variation reveals independent selection towards small body size in Chinese Debao pony[J]. Genome biology and evolution, 2015: evv245. doi: 10.1093/gbe/evv245
适用场景
- 动物遗传进化研究：分析德保矮马与其他马群体的遗传分化，揭示体型选择的分子机制。
- 候选基因验证：验证HMGA2、TBX3等基因在马体型选择中的作用，探索独立进化事件。
- 马品种遗传评估：利用SNP数据进行中国马群体的遗传多样性分析和品种鉴定。
- 体型性状关联分析：结合表型数据开展马体型性状的全基因组关联研究，挖掘关键功能基因。
