数据集概述
本数据集围绕养殖奇努克鲑鱼的适应性状展开全基因组关联分析，涉及洄游时间、体长体重、性成熟年龄、产卵时间及日生长系数等六个性状。通过9108个限制性位点相关标记和随机森林方法，识别性状关联基因座，并对比两种养殖管理策略对基因变异的影响，为保护策略评估提供基因组学依据。
文件详解
- 数据文件
- 文件名称：Random_forest_traits_input_files.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：随机森林性状分析的输入数据文件，包含用于分析的原始数据信息
- 代码文件
- 文件名称：Phenotype_comparisons_2010.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：2010年表型比较分析的R脚本文件
- 代码文件
- 文件名称：Code_correct_for_covariates_before_RF.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：随机森林分析前校正协变量的代码文件
- 代码文件
- 文件名称：R script for Random Forest analyses of six fitness traits.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：六个适应性状随机森林分析的R脚本文件
数据来源
标题为“Genomewide association analyses of fitness traits in captive-reared Chinook salmon: applications in evaluating conservation strategies”的研究
适用场景
- 水产养殖基因组学研究: 分析奇努克鲑鱼适应性状的基因组关联位点，识别潜在适应性基因
- 养殖管理策略评估: 对比不同养殖管理策略对性状关联基因变异的影响，验证保护策略有效性
- 适应性性状遗传机制研究: 探究洄游时间、生长发育等适应性状的遗传基础及驯化选择响应
- 保护遗传学应用: 开发性状特异性工具，监测养殖与野生种群的遗传变化，支持物种保护决策
