数据集概述
本数据集包含两种蝾螈(Ambystoma talpoideum和A. opacum)的基因组数据,用于研究种群大小在生态时间尺度上的变化。通过对不同时间点样本的ddRAD数据和SNP基因型分析,结合标记重捕数据验证基因组方法推断种群历史的有效性,为生态学和进化研究提供遗传层面的证据支持。
文件详解
- 文件名称:fsc2_runfiles.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含用于种群历史推断的fsc2分析相关运行文件,可能涉及群体遗传学模型参数设置、输入输出脚本等内容,支持基于溯祖理论的种群动态模型比较。
- 文件名称:SNP_genotypes.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含两种蝾螈不同时间点样本的单核苷酸多态性(SNP)基因型数据,涵盖A. opacum(1993、2013年)和A. talpoideum(1984、2011年)的遗传变异信息,为种群大小变化的基因组信号检测提供基础数据。
数据来源
论文“Data from: Genomic data detect corresponding signatures of population size change on an ecological time scale in two salamander species”
适用场景
- 种群动态基因组学研究:利用SNP基因型数据检测蝾螈种群大小变化的遗传信号,验证基因组方法在生态时间尺度上的适用性。
- 生态学与进化交叉研究:结合标记重捕数据,分析种群衰退(A. talpoideum)和扩张(A. opacum)的遗传机制与环境因子(如湿地水文周期)的关联。
- 群体遗传学方法验证:通过两种蝾螈的对比分析,评估基于溯祖理论的种群历史推断方法的可靠性与局限性。
- 保护生物学应用:为两栖动物种群监测和保护管理规划提供基因组层面的技术支持,辅助制定针对性的物种保护策略。