根枝原阿菲利虫序列比对与系统发育树数据集

数据集概述

本数据集为海洋寄生虫根枝原阿菲利虫(Protaphelidium rhizoclonii)相关研究的补充数据,包含其序列比对数据及系统发育树分析结果,支持该物种在阿菲利虫系统发育树基部环境类群地位的研究。

文件详解

该数据集由主目录及两个子目录组成,具体说明如下: - 主目录(Sequence alignment data and trees for Protaphelidium rhizoclonii/): - alignment.fa: FASTA格式的序列比对文件,存储核心序列比对数据。 - mrbyes子目录(mrbyes/): - 包含系统发育分析软件MrBayes运行相关文件,如infile.nex(输入文件)、infile.nex.con.tre(一致性树文件)、done.txt(运行完成标记)、_JOBINFO.TXT(任务信息)等。 - raxml子目录(raxml/): - 包含系统发育分析软件RAxML运行相关文件,如RAxML_bestTree.result(最优树文件)、RAxML_bipartitions.result(带支持率的树文件)、done.txt(运行完成标记)、_JOBINFO.TXT(任务信息)等。

适用场景

  • 微生物分类学研究: 用于分析根枝原阿菲利虫的系统发育位置及分类地位。
  • 分子进化分析: 探究阿菲利虫类群的进化关系与遗传多样性。
  • 寄生虫学研究: 支持海洋寄生虫根枝原阿菲利虫物种描述及相关生物学特性研究。
  • 生物信息学方法验证: 可作为系统发育树构建工具(MrBayes、RAxML)应用的案例数据。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 7.25 MiB
最后更新 2025年11月26日
创建于 2025年11月26日
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