数据集概述
本数据集为研究人肠道发育异常组织空间基因表达的手稿配套数据，采用NanoString GeoMx数字空间分析技术（DSP）生成。包含患者活检样本中感兴趣区域（AOIs）的基因表达测量数据及对应样本元数据，涉及CD14、CEBPB等8个基因，支持肠道疾病空间转录组研究。
文件详解
- GeoMx_DSP_data.rds
- 文件格式：RDS
- 字段映射介绍：R序列化对象，含空间转录组数据集，包括分析用表达数据（CD14、CEBPB、MPO、OSM、CCL2、ICAM1、IL1B、VEGFA）及元数据
- GeoMx_DSP_expression_data.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：Excel文件，含GeoMx DSP生成的基因表达矩阵
- GeoMx_DSP_metadata.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：Excel文件，含每个感兴趣区域（AOI）的元数据，包括疾病表型、患者ID、样本类型
- README_GeoMx_DSP.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：数据集说明文档，含标题、研究背景及文件清单
适用场景
- 肠道发育异常空间转录组研究: 分析人肠道发育异常组织中特定基因（如CD14、IL1B）的空间表达模式
- 肠道疾病分子机制分析: 结合元数据探究疾病表型与基因表达的关联
- 医学样本空间异质性研究: 基于AOI层面数据解析肠道组织不同区域的基因表达差异
- 肠道疾病生物标志物筛选: 挖掘与肠道发育异常相关的潜在分子标志物
