GFvoter_Supplementary_Files_基因融合检测实验补充材料

数据集概述

本数据集为论文“Detection of Gene Fusions in Long-Read Transcriptome Sequencing Data with GFvoter”的补充材料,包含GFvoter及其他基因融合检测工具的运行命令、检测结果,以及真实和模拟RNA测序数据集的基因融合基准事件,共5个文件,支持实验结果的复现与工具性能评估。

文件详解

  • run_command.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:包含运行GFvoter及其他基因融合检测工具的精确命令,记录实验所用参数与选项,确保实验可复现。
  • Results of GFvoter.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:压缩包内为GFvoter工具生成的输出结果,包含基因融合检测结果及各方法对最终融合调用的贡献评分向量。
  • Results of Others.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:压缩包内为研究中使用的其他基因融合检测工具的输出结果,用于与GFvoter的检测结果对比。
  • realdata_ground_truth.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:真实RNA测序数据集的基因融合基准事件列表,用于评估GFvoter及其他工具在真实数据上的准确性,数据源自https://github.com/Oshlack/JAFFA/blob/master/known_fusions.txt。
  • simulatedata_ground_truth.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:模拟RNA测序数据集的基因融合基准事件列表,格式为基因融合对(如AADAT:VMP1),用于评估工具在模拟数据上的性能。
  • README.md
  • 文件格式:MD
  • 字段映射介绍:数据集说明文档,概述补充材料的内容与各文件用途。

数据来源

论文“Detection of Gene Fusions in Long-Read Transcriptome Sequencing Data with GFvoter”

适用场景

  • 基因融合检测工具评估:对比GFvoter与其他工具在真实和模拟数据集上的检测准确性。
  • 生物信息实验复现:使用run_command.txt中的命令复现论文中的基因融合检测实验。
  • 基因融合基准数据应用:利用真实和模拟基准事件验证新基因融合检测方法的性能。
  • 基因融合评分机制研究:分析GFvoter结果中的评分向量,探究多方法融合的基因融合检测策略。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 5.82 MiB
最后更新 2026年1月15日
创建于 2026年1月15日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。